Conocimientos previos
Microarreglos
Genotipo
Fenotipo
Haplotipo
SNP
Variación genética
Descripción
La genotipificación por microarreglos es el método usado para determinar las variaciones genéticas ( variación genética ) específicas que existen en los genes de un individuo. El estudio de los genes es crucial para comprensión de los procesos biológicos normales en una célula y, por lo tanto, los que llevan a una enfermedad. La genotipificación de microarreglos de ADN nos permite estudiar muchos puntos dentro de un genoma (el cual está compuesto por miles de genes) a la vez. En la investigación biomédica estas técnicas sirven para identificar tipos virales, SNP asociados a enfermedades, análisis de ancestría, etc 1 2 .
Entrada/Muestra
Secuencia de métodos
1. Método de Extracción de ADN o
2. Método de Extracción de ARN total NIVEL: INTERMEDIO 1
2.1 Método de Aislamiento de ARNm y síntesis de ADNc NIVEL: INTERMEDIO
2.2 Método de Electroforesis (gel de agarosa y poliacrilamida) NIVEL: INTERMEDIO
3. Método Cuantificación del ADN o ADNc: se mide la concentración de ácidos nucleicos en una muestra y se agrega una cantidad determinada por el usuario.
4. Método de Microarreglo de ADN Nivel: Intermedio
5. Análisis de un microarreglo (Bioinformática): se emplean herramientas bioinformáticas para analizar las secuencias del genoma, así como realizar alineamientos múltiples de las secuencias, árboles filogenéticos,softwares de análisis de las variaciones (ej.: R/Biocondoctor 2 , GenomeStudio, etc.)
Salida/Resultado
Análisis de las variaciones dentro de un genoma o un transcriptoma.
Procesos alternativos
Genotipificación por Sanger
Genotipificación por secuenciación de alto rendimiento
Aplicaciones
GWAS
Mapeo de alta densidad genética
Filogenómica
Genómica ecológica y de conservación
Marker assisted selection (MAS)
SNPs
Ancestria
Farmacogenómica
Temas relacionados
GWAS
Mapeo de alta densidad genética
Filogenómica
Genómica ecológica y de conservación
Marker assisted selection (MAS)
SNPs
Ancestria
Farmacogenómica
Notas
El análisis del número de SNP es limitado y va desde 10,000 hasta un poco más de 900,000 3 .
Cómo citar: Checa Rojas, A. (2016, 22 de Junio ) Genotipificación por microarreglos. Conogasi, Conocimiento para la vida. Fecha de consulta: Octubre 11, 2024
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