Es el estudio del origen, formación y desarrollo evolutivo general de una especie biológica. Este estudio puede llevarse a cabo también entre poblaciones de organismos. En la biología esto se descubre a través de datos morfológicos (formas corporales de los organismos) y/o de la secuenciación de sus genes o genomas (Filogenetica y Filogenomica).

Ejemplo de uso: las filogenias se pueden representar como “árboles genealógicos” de grupos de especies estrechamente relacionadas, pero también podemos usar una filogenia para describir las relaciones entre todas las formas de vida.