Consiste en la comparación de dos o más secuencias biológicas como ADN, ARN o proteína, provenientes de diferentes individuos o especies.
Ejemplo de uso:
“Alinear lecturas a un genoma de referencia es el primer paso en muchos protocolos de genómica comparativa, incluyendo protocolos para la determinación de variantes, cuantificación de isoformas y expresión diferencial de genes.”