Es una técnica utilizada para la identificación de proteínas mediante un reconocimiento antígeno-anticuerpo. Primero, las proteínas deben ser separadas mediante electroforesis y posteriormente deben ser transferidas a una membrana; para después agregar los anticuerpos que reconocerán la proteína específica o de interés.
Ejemplo de uso: el Western blot es una de las técnicas más usadas en campo de la biología molecular y en el diagnóstico clínico de muchas enfermedades, como: detección de VIH, enfermedad de Lyme o encefalopatía espongiforme bovina, entre otras.