Los elementos en cis son regiones de ADN no codificante dentro de un genoma que regulan la transcripción de genes cercanos. El concepto surge para diferenciarlos de los elementos reguladores en trans. Los elementos reguladores cis están presentes en la misma molécula de ADN como gen regulador.

Ejemplo de uso: Los CREs son fundamentales en la regulación de las redes genéticas y controlan procesos biológicos como: la morfogénesis, el desarrollo de la anatomía y aspectos de la biología evolutiva del desarrollo (evo-devo).