genoma de referencia

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Es un conjunto de datos que tiene como objetivo modelar y representar la secuencia de ADN, o genoma, de una…

Es un conjunto de datos que tiene como objetivo modelar y representar la secuencia de ADN, o genoma, de una especie. Los genomas de referencia son ensamblados por científicos para servir como secuencias de ADN representativas de distintas especies que, posteriormente, pueden ser analizadas y comparadas. Comúnmente, un genoma de referencia cambia conforme las técnicas de secuenciación y ensamblado de genomas son mejoradas. Por ejemplo, la última referencia del genoma humano (GRCh38/hg38) fue producida por el Genome Reference Consortium en diciembre del 2013.

Ejemplo de uso:

“Para cuantificar la abundancia de transcritos usando RNA-seq, cada secuencia corta es comparada contra un genoma de referencia anotado.”

Referencias:

Genome reference consortium. (2016). Consultada el 8 de agosto de 2016 desde http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/genome/assembly/grc/ DbSNP home page. (2014, Mayo 21). Consultada el 8 de agosto de 2016 desde http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/ Reference SNP (refSNP) cluster report: Rs4988235 Consultada el 8 de agosto de 2016 desde http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/snp_ref.cgi?searchType=adhoc_search&type=rs&rs=rs4988235
Stevenson, K. R., Coolon, J. D., & Wittkopp, P. J. (2013). Sources of bias in measures of allele-specific expression derived from RNA-seq data aligned to a single reference genome. BMC Genomics, 14(1), 536. doi:10.1186/1471-2164-14-536
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Cómo citar: Alquicira, J. (2017, 26 de Junio ) genoma de referencia. Conogasi, Conocimiento para la vida. Fecha de consulta: Noviembre 23, 2024

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