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Farmacogenómica: rumbo a una medicina personalizada

Conocimientos previos: ADN Gen SNP Genómica GWAS Evolución Metabolismo de Fármacos Resumen Desde el primer reporte del genoma humano los científicos se han propuesto grandes retos que lleven al progreso significativo de la medicina clínica. Los investigadores han descubierto que existen genes que albergan variaciones que contribuyen al desarrollo de enfermedades, y que además algunos responden al tratamiento del paciente.… leer más "Farmacogenómica: rumbo a una medicina personalizada"
Nivel avanzado
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Método: Gel de poliacrilamida para proteínas

Introducción  La electroforesis es un método por el cual se separan moléculas por tamaño o peso molecular usando un campo eléctrico. La separación se realiza comúnmente en un gel que funciona como filtro poroso y está constituido habitualmente de materiales como agarosa o poliacrilamida. Su principal uso es la separación de mezclas de biopolímeros especialmente de ácidos nucleicos (ADN o… leer más "Método: Gel de poliacrilamida para proteínas"
Nivel intermedio
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SNP Calling

Conocimientos previos Secuenciación de alto rendimiento Ensamblado de genoma Alineamiento SNP   Descripción El método de SNP calling tiene el objetivo de determinar en qué posiciones del genoma existe  al menos una base nitrogenada distinta a la de un genoma de referencia. Para lograr esto, se analiza a las secuencias cortas (llamadas lecturas o reads)  pertenecientes a fragmentos de ADN secuenciados. Después… leer más "SNP Calling"
Nivel intermedio
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Ensamblado de secuencias

Conocimientos previos Genoma Secuenciación Lectura   Descripción El ensamblado es un procedimiento bioinformático cuya finalidad es reconstruir la secuencia original de una muestra fragmentada por cualquier método de secuenciación. Los algoritmos dedicados a esto trabajan bajo la suposición de que fragmentos similares de lecturas se originan de una misma posición en el genoma. Esto se traduce en que el software… leer más "Ensamblado de secuencias"
Nivel avanzado
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Ensamblado de secuencias

Conocimientos previos Genoma Secuenciación Lectura   Descripción El ensamblado es un procedimiento bioinformático cuya finalidad es reconstruir la secuencia original de una muestra fragmentada por cualquier método de secuenciación. Este proceso depende fuertemente de realizar una secuenciación profunda, pues los algoritmos dedicados a esto trabajan bajo la suposición de que fragmentos similares de lecturas se originan de una misma posición… leer más "Ensamblado de secuencias"
Nivel intermedio
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Inferencia (faseo) de haplotipos

Conocimientos previos Haplotipo SNP Alelo Secuenciación de alto rendimiento SNP calling Descripción La inferencia de haplotipos, también llamada ‘faseo',  consiste en una estimación sobre qué alelos se encuentran co-localizados en un mismo cromosoma . Es relevante obtener dichos datos a partir de genotipos obtenidos de experimentos de, por ejemplo, SNP calling para poder realizar inferencias sobre variación genética.   Entrada/Muestra Archivo… leer más "Inferencia (faseo) de haplotipos"
Nivel básico
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Microarreglo de ADN

Conocimientos previos ADN Transcripción Aislamiento de ARNm y síntesis de ADNc Expresión génica Genotipo Fenotipo Transcriptoma Genoma  Descripción   Los microarreglos son una herramienta de la biología molecular y las ciencias genómicas con diversas aplicaciones, medir o cuantificar la  expresión génica  o  identificar mutaciones  en genes específicos para el diagnóstico de enfermedades entre otras aplicaciones.  Para el uso del microarreglo se utiliza… leer más "Microarreglo de ADN"
Nivel básico
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Extracción de ADN

Conocimientos previos Célula División celular ADN Introducción  Es un método por el cual se obtiene el ADN a partir de las células y puede provenir de un cepillado bucal,vaginal, cervical, de fluidos como la saliva, la sangre o casi cualquier parte de un organismo. La extracción consiste en separar el ADN de otros componentes celulares (como la membrana o las proteínas)… leer más "Extracción de ADN"
Nivel básico
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Extracción de ARN total

Conocimientos previos Célula ARN Expresión génica Transcripción del ADN Descripción Es un método por el cual se separa el ARN de otros componentes celulares. En la investigación biomédica suele utilizarse este método como un paso previo para estudiar otros tipos de ARN, como los ARNm mensajeros (ver Método aislamiento del ARNm) en una enfermedad o en alguna condición de interés. Entrada/Muestra Material biológico:  células , tejido, etc Recursos/Material… leer más "Extracción de ARN total"
Nivel básico
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Electroforesis en gel

Conocimientos previos Extracción de ADN PCR Proteínas Extracción de proteínas Descripción La electroforesis es un método por el cual se separan mezclas de moléculas de acuerdo a su tamaño a través de un gel , funcionando como un filtro. Normalmente, se utiliza para separar moléculas de ADN , ARN  o  proteína . EL ADN y el ARN poseen una carga negativa y migran las moléculas hacia… leer más "Electroforesis en gel"